La filtration mécanique est essentielle pour obtenir une eau propre et claire. Le filtre de piscine est positionné immédiatement après la pompe de filtration qui met l'eau en circulation. La filtration s'opère par le passage de l'eau à travers un média filtrant (sable, gravier, verre éco filtrant, zéolithe) ou avec une cartouche. Les impuretés sont retenues et l'eau est assainie. Il existe différents systèmes filtrants, le plus courant étant le filtre à sable. Les piscines hors sol sont souvent équipées d'un filtre à cartouche, plus simple à utiliser au quotidien. Le plus performant d'entre tous est le filtre à diatomée, avec une finesse de filtration inférieure à 5 microns, mais il est plus rare et onéreux. L'association de la pompe piscine et du filtre forme le système de filtration qui doit être dimensionné en fonction du volume du bassin. Le volume d'eau de la piscine doit être complètement filtré en 4 heures. Pour une piscine de 60 m3 il faudra donc prévoir une filtration d'un débit de 15 m3/h environ.
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